בעשור השישי לקיומה של מדינת ישראל מתרחשים בה תהליכים שונים מבית ומחוץ המסכנים את קיומנו כמדינה יהודית דמוקרטית: הסכסוך המתמשך עם הפלשתינאים ועם מדינות ערב, פערים מעמיקים בתחומים חברתיים, כלכליים, תרבותיים ודתיים, ובמיוחד נטייתם של רבים להסיר מעליהם אחריות ולוותר על פעילות משמעותית למען הכלל. מכינת הנגב קוראת לבני הנוער להוביל מגמות חדשות בחברה הישראלית. המכינה מכשירה ומעודדת את חניכיה לקחת אחריות בכל מקום שיגיעו אליו - בצבא ובחברה האזרחית - לגלות מנהיגות ולהוביל תהליכים של יזמה ושל עשייה.

לימודים והרחבת דעת: הלימוד הוא יסוד מרכזי במכינת הנגב. מטרת הלימודים: לסייע לחניכים בגיבוש השקפת עולם מורכבת הנשענת על ערכים יהודים-הומניסטיים, להכיר את שורשיהם ולהבין את התהליכים העוברים על החברה הישראלית.
צוות ההוראה והמדריכים מבקשים לפתח אצל החניכים תשוקה ללימוד ולרכישת ידע, וכלים ללמידה. כל זאת תוך יצירת עומק אינטלקטואלי, שהוא מרכיב הכרחי בפיתוח מנהיגות.
נושאי הלימוד: החברה הישראלית,יהדות חילונית, ציונות והיסטוריה, עיונים בפרשת השבוע, מחזור התפילה, מדיניות ציבורית וקיימות, מנהיגות וניהול, לימודי נגב.

המכינה רואה בשירות הצבאי הזדמנות משמעותית לבוגריה ליישם דרך חיים של עשייה חינוכית וחברתית. המכינה מעודדת כל אחד מחניכיה ומבוגריה להגיע לתפקידי מפתח בצבא, ומאמינה כי לאחר שנת המכינה החניכים יצאו ובידיהם הכלים להתייצב כ"מורי דרך" בצמתים מוסריים, ערכיים וחינוכיים ולתרום לשיפור תהליכים פיקודיים וחברתיים בצבא. המכינה מכוונת את כלל חניכיה לבצע שירות משמעותי במגמות פיקוד והדרכה.